발행년 : | 2002 |
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구분 : | 학위논문 |
학술지명 : | 학위논문(석사)-- 경기대학교 대학원: 전자계산학과 데이터베이스 |
관련링크 : | http://www.riss.kr/link?id=T8619572 |
웹 기반의 유전자 서열 분석 및 관리 시스템의 설계 및 구현
초록[abstracts]
휴먼 게놈 프로젝트등 급속한 발전을 보이고 있는 생명 과학 연구들로 인하여 생명체에 관한 많은 정보가 늘어나고 있다. 이러한 다량의 정보를 효과적으로 분석하고 관리하기 위해서 생물정보학(Bioinformatics) 기술에 대한 관심도 따라서 증가하게 되었다. 인간을 비롯하여 많은 생명체의 일부 또는 전체의 유전자 염기 서열이 밝혀졌다. 이러한 유전자 염기 서열을 바탕으로 유전자의 구조와 기능을 밝히는 구조/기능 유전체학(Structural/Functional Genomics)과 개체간의 차이, 환경에 대한 차이 등을 밝히는 비교 유전체학(Comparative Genomics)등에 관한 연구가 활발히 진행되고 있다. 기존의 생명과학 실험실에서 발생된 서열 데이터는 정확한 표준이 없기 때문에 효율적으로 관리되지 않았다. 실험실에서는 임의의 형식을 정하여 그 형식에 맞도록 작성된 텍스트 파일로 관리하였기 때문에 효율적인 데이터의 관리가 이루어지지 않았다. 또한 서열분석 방법에 따라서 사용되는 프로그램의 종류가 매우 다양하고, 수행환경에 따라서 사용되는 프로그램이 다르고, 또한 프로그램간의 연동이 되지 않기 때문에 분석작업이 어렵고 불편하였다. 이러한 문제점을 해결하기 위해서 유전자 서열 데이터를 저장하고 관리할 수 있으며, 또한 다양한 분석 작업을 수행 할 수 있는 시스템이 필요하다. 본 논문에서는 웹 기반의 유전자 서열 분석 및 관리 시스템인 GWB(Gene WorkBench)를 설계 및 구현하였다. GWB는 다양한 분석 방법을 지원하며, 또한 관계형 데이터베이스를 사용하여 효율적인 서열 데이터를 관리 할 수 있도록 하였다.
초록[abstracts] Interests of bio technologies for analyzing and managing much of these information efficiently have been grown according as it was increased that imformation about living things originated from gene, because of the study of life science showing a fast growth by HGP. Now the entire or part of gene sequences about living things starting from human has been revealed. and that the research for comparative genomics researching structural/functional genomics revealing the structure or functions of each gene, deferences between individual variations or environments is being studyed actively. In former days, data management did not become in a laboratory. Because there was no correct standard. Program used in sequence analysis is very various. This programs are different according to data and execution environment. Also, analysis task is difficult because do not get into gear between program. To solve these problem, They must manage a laboratory of life science that use gene sequence data by itself. It must have function that have various analysis function, and manage sequence data. In this paper, GWB(Gene WorkBench) that is gene sequence analysis and management system design and implementations. Can management and analysis gene sequence data of laboratory interior using database.